La Policía Federal se instaló en Villa María en 1987. En 1988 fue elevada de rango a la categoría de Subdelegación, permaneciendo en este orden de jerarquía hasta enero de 2009, cuando fue elevada a la categoría de Delegación.
En la actualidad la Jefatura de la Delegación Villa María, se halla a cargo del Comisario Antonio Eduardo Asoña y el Subcomisario David Alberto Zeballos.
La jurisdicción de esta delegación comprende los departamentos General San Martín, Tercero Arriba y Juárez Celman y se desempeña como auxiliar de la Justicia Federal de Villa María y Río Cuarto.
La Policía Federal, por competencia, combate el narcotráfico, la trata de personas y el contrabando.
Igualmente colabora en los procedimientos que efectúan otros órganos de contralor del Estado Nacional tales como la Administración Federal de Ingresos Públicos (AFIP), la Comisión Nacional de Comunicaciones, la Comisión Nacional de Regulación del Transporte y Aduana, entre otras.